Los tipos de beca que se ofrecen dentro de los programas académicos son los siguientes:
Beca de Secretaría de Salud (SSA): Aplica a los programas de Especialidades y Subespecialidades Médicas.
Beca de CONACYT: Aplica a los programas reconocidos dentro del PNPC de Especialidades y Subespecialidades Médicas; además de los programas de Maestría y Doctorado en Ciencias.